Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms