Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms