Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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