Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms