Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136 ms