Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms