Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms