Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FYCO1Q9BQS8 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FYCO1Q9BQS8 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FYCO1Q9BQS8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FYCO1Q9BQS8 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FYCO1Q9BQS8 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FYCO1Q9BQS8 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FYCO1Q9BQS8 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FYCO1Q9BQS8 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
FYCO1Q9BQS8 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FYCO1Q9BQS8 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FYCO1Q9BQS8 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FYCO1Q9BQS8 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FYCO1Q9BQS8 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
FYCO1Q9BQS8 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FYCO1Q9BQS8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FYCO1Q9BQS8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms