Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN18Q99952 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms