Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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