Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPFIBP1Q86W92 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms