Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms