Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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