Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 OR1I1-202ENST00000641398 5984 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 NPAP1-201ENST00000329468 7526 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms