Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FXNQ16595 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FXNQ16595 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FXNQ16595 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FXNQ16595 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FXNQ16595 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FXNQ16595 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FXNQ16595 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FXNQ16595 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FXNQ16595 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FXNQ16595 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FXNQ16595 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FXNQ16595 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FXNQ16595 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FXNQ16595 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FXNQ16595 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FXNQ16595 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FXNQ16595 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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FXNQ16595 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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FXNQ16595 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FXNQ16595 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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FXNQ16595 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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FXNQ16595 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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FXNQ16595 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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FXNQ16595 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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FXNQ16595 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FXNQ16595 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FXNQ16595 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FXNQ16595 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FXNQ16595 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FXNQ16595 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FXNQ16595 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FXNQ16595 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FXNQ16595 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FXNQ16595 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FXNQ16595 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FXNQ16595 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FXNQ16595 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FXNQ16595 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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