Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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