Protein–RNA interactions for Protein: Q13686

ALKBH1, Nucleic acid dioxygenase ALKBH1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH1Q13686 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ALKBH1Q13686 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms