Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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CUL3Q13618 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CUL3Q13618 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CUL3Q13618 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CUL3Q13618 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CUL3Q13618 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CUL3Q13618 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CUL3Q13618 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CUL3Q13618 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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