Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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