Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms