Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
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