Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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FOXC1Q12948 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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FOXC1Q12948 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AL356019.1-201ENST00000553419 748 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 ETFRF1-209ENST00000556885 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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FOXC1Q12948 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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FOXC1Q12948 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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FOXC1Q12948 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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FOXC1Q12948 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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FOXC1Q12948 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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