Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 RN7SL340P-201ENST00000470792 296 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms