Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms