Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms