Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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HOXD12P35452 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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HOXD12P35452 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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HOXD12P35452 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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HOXD12P35452 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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HOXD12P35452 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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HOXD12P35452 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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HOXD12P35452 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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