Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms