Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPREP23469 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPREP23469 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPREP23469 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPREP23469 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPREP23469 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPREP23469 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPREP23469 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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