Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms