Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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