Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms