Protein–RNA interactions for Protein: P00966

ASS1, Argininosuccinate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASS1P00966 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASS1P00966 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASS1P00966 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASS1P00966 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASS1P00966 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASS1P00966 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASS1P00966 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASS1P00966 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASS1P00966 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASS1P00966 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASS1P00966 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASS1P00966 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASS1P00966 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASS1P00966 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASS1P00966 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASS1P00966 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASS1P00966 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASS1P00966 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASS1P00966 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ASS1P00966 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASS1P00966 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms