Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SCN2BO60939 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SCN2BO60939 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SCN2BO60939 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SCN2BO60939 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SCN2BO60939 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SCN2BO60939 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SCN2BO60939 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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SCN2BO60939 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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