Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC9O60706 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC9O60706 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC9O60706 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC9O60706 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC9O60706 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC9O60706 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC9O60706 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC9O60706 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC9O60706 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC9O60706 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC9O60706 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC9O60706 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC9O60706 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC9O60706 HRASLS2-201ENST00000255695 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
ABCC9O60706 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ABCC9O60706 MT-ND6-201ENST00000361681 525 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
ABCC9O60706 FAM25E-201ENST00000411791 322 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
ABCC9O60706 CFL1P1-204ENST00000456375 424 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
ABCC9O60706 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ABCC9O60706 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC27.51■■■□□ 2
ABCC9O60706 HAX1-211ENST00000532105 771 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
ABCC9O60706 RN7SL460P-201ENST00000582806 258 ntBASIC27.51■■■□□ 2
ABCC9O60706 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
ABCC9O60706 Metazoa_SRP.152-201ENST00000614413 286 ntBASIC27.51■■■□□ 2
ABCC9O60706 KRT18P45-201ENST00000515347 1333 ntBASIC27.51■■■□□ 2
ABCC9O60706 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ABCC9O60706 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 AC006273.1-201ENST00000606966 861 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 OR2C1-201ENST00000304936 1406 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 POLR2J2-203ENST00000476151 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 MIR100HG-219ENST00000533109 1794 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 GRP-201ENST00000256857 848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 AL161644.1-201ENST00000426901 1111 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 FAM153C-208ENST00000511189 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 AC109597.2-201ENST00000569407 927 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 OR52N1-201ENST00000317078 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 PTPA-219ENST00000435305 530 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 AL583804.1-201ENST00000448643 810 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 MECP2-226ENST00000640414 897 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 RN7SL646P-201ENST00000492969 297 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 AC100778.4-201ENST00000581232 582 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms