Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms