Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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HDGFL3Q9Y3E1 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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HDGFL3Q9Y3E1 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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HDGFL3Q9Y3E1 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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HDGFL3Q9Y3E1 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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HDGFL3Q9Y3E1 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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HDGFL3Q9Y3E1 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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HDGFL3Q9Y3E1 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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HDGFL3Q9Y3E1 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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HDGFL3Q9Y3E1 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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