Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CNTN3Q9P232 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CNTN3Q9P232 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CNTN3Q9P232 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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