Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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