Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TRIM4Q9C037 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TRIM4Q9C037 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TRIM4Q9C037 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TRIM4Q9C037 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TRIM4Q9C037 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TRIM4Q9C037 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TRIM4Q9C037 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TRIM4Q9C037 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TRIM4Q9C037 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TRIM4Q9C037 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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TRIM4Q9C037 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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