Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFT74Q96LB3 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT74Q96LB3 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms