Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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SGF29Q96ES7 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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SGF29Q96ES7 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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SGF29Q96ES7 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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SGF29Q96ES7 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SGF29Q96ES7 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SGF29Q96ES7 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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