Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms