Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms