Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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