Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VPS8Q8N3P4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS8Q8N3P4 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms