Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms