Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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ATG4DQ86TL0 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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ATG4DQ86TL0 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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ATG4DQ86TL0 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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ATG4DQ86TL0 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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