Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms