Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms