Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms